日本废止中医（汉方医）的核心原因是明治维新期间政府推行的全盘西化政策，旨在通过医学现代化实现国家崛起，‌直接动因包括解剖学发现中医理论错误、西医在战争中展现实效性，以及“脱亚入欧”思潮的推动‌，这一过程历时30余年（1874-1906年）。‌‌

日本中医（汉方医）自唐代传入后长期主导医疗体系，但18世纪起西方医学（兰方医）的传入埋下变革种子。

1771年，杉田玄白团队通过解剖发现人体结构与中医典籍（如《黄帝内经》）描述的“六叶两耳”等理论严重不符，证实中医解剖学“虚妄”，而荷兰医书《解体新书》的记载更准确，引发医学界对汉医的信任危机。

戊辰战争期间，西医的外科手术和消毒技术显著降低日军伤亡率，降幅达50%，而传统中医对枪伤感染束手无策，迫使日本政府转向西医。


明治政府1868年起将医学改革纳入国家现代化战略，核心是“脱亚入欧”思潮下的全盘西化。

‌1874年颁布《医制》，规定医生必须通过西医考试；1883年彻底废除汉医执业资格，关闭官设汉医学校，并实施医师考试制度（西洋七科考试），阻断汉医传承途径。

‌建立西医学校如顺天堂医院，派遣留学生赴欧美学习，并推广疫苗接种如牛痘法和公共卫生技术，至1906年基本完成中医废止。

19世纪细菌学、疫苗和化学制药的突破使西医在传染病防治如梅毒、天花上远超中医，日本通过西医推广在20世纪初基本消灭天花，而中医的“胎毒”理论被证伪。

‌明治维新后“脱亚入欧”成为日本国策，日本社会对西方文明的崇尚削弱了对汉文化的依赖，医学领域被视为国家现代化的关键环节。